計測技術の進歩により、生命科学における実験データが大量に生産され、その解析結果が文献情報として大量に蓄積されつつあり、これら大量の文献情報を活用した実験データの意味付けが益々重要になっている。先端研の生命科学及び情報科学の研究室と連携しこれら大量の生命科学の実験データを解析する技術、データベースなどの情報処理システムを構築し、生物医学の観点から意味を抽出するための情報処理技術を開発している。
具体的には、マイクロアレイ解析、プロテオーム解析向けの蛋白質間の相互作用を込み入った文献情報から有効に抽出し、蛋白質間の相互作用ネットワークを構築するシステムを開発している。このシステムによって、重要な相互作用の関係性あるいは新たな機能の予測を行い、創薬などの生命科学における研究開発を一挙に加速することを目指している。