財務状況 2009年度
（単位：円）
| 運営費交付金（人件費） | 761,535,005 |
| 運営費交付金（物件費） | 423,891,813 |
| 小計 | 1,185,426,818 |
| 科学研究費補助金 | 612,930,000 |
| 小計 | 612,930,000 |
| その他補助金 | 11,993,846 |
| 小計 | 11,993,846 |
| 寄附金 | 198,656,274 |
| 小計 | 198,656,274 |
| 寄附研究部門 | 42,500,000 |
| 小計 | 42,500,000 |
| 共同研究費 | 383,326,936 |
| 受託研究費 | 2,130,211,627 |
| 小計 | 2,513,538,563 |
| 科学技術振興調整費 | 0 |
| 科学技術振興費 | 21,538,462 |
| 小計 | 21,538,462 |
| 競争的資金による間接経費 | 294,077,765 |
| （内、本部への振替分） | （129,110,282） |
| 小計 | 294,077,765 |
| 合計 | 4,880,661,728 |
